Vaikutamme yhteiskunnallisesti omien arvojemme pohjalta, joita ovat ilo ja hyvinvointi, yhdenvertaisuus, utelias pohdinta sekä vastuullisuus. Olemme avoimesti antirasistinen, antifasistinen, antiableistinen ja feministinen nuorisojärjestö. Tavoitteenamme on lisätä nuorten mahdollisuuksia osallistua yhteiskuntaan ja vaikuttaa itseään koskeviin päätöksiin. Olemme ottaneet kantaa mm. seksuaali- ja sukupuolivähemmistöjen oikeuksien puolesta sekä ilmastonmuutosta ja luontokatoa vastaan.

Protu tekee jatkuvaa yhteistyötä Protusin (Ruotsin Protu) ja Setan (Seta-vierailijat leireillä) kanssa. Protu on jäsenenä Helsingin nuorissa ajattelijoissa (Nufit), Nuorisoala ry:ssä (nuorisojärjestöjen kattojärjestö), Kansalaisareenassa, Ehytissä (Ehkäisevä päihdetyö), Kulttuuri-, mielipide- ja tiedelehtien liitto Kultti ry:ssä ja Palvelualojen työnantajat PALTA ry:ssä.